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19 months ago
bioinfo223
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Hello, I need to predict the mature miRNA from the precursor miRNA. how can I get the input structure file for MatureBayes?
like this
>hsa-mir-124-2 MI0000444 hairpin:47:57 mature:24:22 mature:61:20
External loop : -60
Interior loop ( 3 ,107 ) CG; ( 3 ,107 ) CG: -240
Interior loop ( 4 ,106 ) AU; ( 4 ,106 ) AU: -210
Interior loop ( 5 ,105 ) AU; ( 5 ,105 ) AU: -90
.(((((..(((((((((((((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..))))))))))))....)))..))))). (-51.20)
I used RNAfold but it gave me output like this
>dre
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