Question: Haploview error (Hapmap data format error)
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gravatar for mmh7272
14 months ago by
mmh727240
mmh727240 wrote:

Hi fellows I used progragm Haploview for haplotyping and ld block anlysis. I input below hapmat file it is happend error screen "Hapmap data a format error: RWG-431" i dont understand why this format is wrong. plz explain detaily and if u have solution, tell me thank u

this is HP file

rs alleles chrom pos strand assembly center protLSID assayLSID panel QCcode RWG-002 RWG-003 RWG-004 RWG-008 RWG-010 RWG-013 RWG-014 RWG-016 RWG-018 RWG-019 RWG-020 RWG-021 RWG-02 2 RWG-024 RWG-027 RWG-028 RWG-029 RWG-030 RWG-031 RWG-032 RWG-033 RWG-034 RWG-035 RWG-037 RWG-038 RWG-04 0 RWG-042 RWG-043 RWG-044 RWG-045 RWG-046 RWG-047 RWG-050 RWG-052 RWG-053 RWG-054 RWG-056 RWG-058 RWG-05 9 RWG-060 RWG-062 RWG-063 RWG-065 RWG-066 RWG-068 RWG-069 RWG-071 RWG-072 RWG-075 RWG-076 RWG-079 RWG-08 0 RWG-081 RWG-083 RWG-084 RWG-085 RWG-086 RWG-087 RWG-088 RWG-090 RWG-092 RWG-093 RWG-094 RWG-095 RWG-09 6 RWG-098 RWG-099 RWG-100 RWG-101 RWG-102 RWG-104 RWG-106 RWG-107 RWG-109 RWG-110 RWG-111 RWG-112 RWG-11 3 RWG-115 RWG-116 RWG-119 RWG-120 RWG-122 RWG-123 RWG-124 RWG-126 RWG-129 RWG-130 RWG-131 RWG-132 RWG-13 3 RWG-135 RWG-136 RWG-138 RWG-139 RWG-141 RWG-142 RWG-143 RWG-144 RWG-145 RWG-147 RWG-151 RWG-152 RWG-15 3 RWG-156 RWG-158 RWG-160 RWG-161 RWG-163 RWG-164 RWG-166 RWG-167 RWG-168 RWG-169 RWG-170 RWG-171 RWG-17 2 RWG-173 RWG-174 RWG-175 RWG-176 RWG-178 RWG-179 RWG-180 RWG-181 RWG-183 RWG-186 RWG-189 RWG-190 RWG-19 1 RWG-192 RWG-193 RWG-194 RWG-196 RWG-197 RWG-198 RWG-199 RWG-200 RWG-201 RWG-202 RWG-203 RWG-204 RWG-20 6 RWG-207 RWG-208 RWG-209 RWG-210 RWG-211 RWG-212 RWG-213 RWG-214 RWG-215 RWG-216 RWG-217 RWG-218 RWG-22 0 RWG-221 RWG-224 RWG-228 RWG-229 RWG-231 RWG-232 RWG-235 RWG-236 RWG-237 RWG-240 RWG-244 RWG-246 RWG-24 7 RWG-248 RWG-249 RWG-250 RWG-251 RWG-252 RWG-253 RWG-254 RWG-255 RWG-256 RWG-257 RWG-259 RWG-260 RWG-26 1 RWG-262 RWG-263 RWG-264 RWG-265 RWG-266 RWG-268 RWG-269 RWG-271 RWG-273 RWG-274 RWG-275 RWG-280 RWG-28 1 RWG-282 RWG-283 RWG-284 RWG-285 RWG-286 RWG-287 RWG-288 RWG-289 RWG-290 RWG-291 RWG-292 RWG-293 RWG-29 4 RWG-295 RWG-296 RWG-297 RWG-299 RWG-316 RWG-322 RWG-323 RWG-324 RWG-325 RWG-326 RWG-327 RWG-328 RWG-33 0 RWG-331 RWG-332 RWG-334 RWG-335 RWG-336 RWG-337 RWG-338 RWG-339 RWG-340 RWG-341 RWG-342 RWG-343 RWG-34 4 RWG-345 RWG-346 RWG-349 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TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT CC TT TT CC TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT CC TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT CC TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT TT 6_1768006 A/C 6 1768006 NA NA NA NA NA NA NA AA AA AA AA AA AA CC AA AA CC AA AA AA AA AA AA CC AA AA CC CC AA AA AA AA AA CC AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA CC AA AA CC CC AA -AA AA AA AA AA CC AA AA CC CC CC AA AA AA AA CC AA AA AA AA AA CC AA AA AA AA AA CC CC AA CC CC AA AA CC AA AA AA AA AA AA AA CC AA AA CC AA AA AA AA AA CC AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA CC AA CC AA AA AA AA CC AA AA AA AA CC CC AA AA AA AA AA AA AA AA AA CC AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA CC AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA CC AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA CC CC AA AA AA AA AA AA 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CC TT CC CC CC CC CC CC CC CC CC CC CC CC CC CC CC CC

snp alignment software error • 655 views
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